Species composition of testate amoebae in Lake Monte Alegre, Ribeirão Preto, SP, Brazil / Composição de amebas testáceas no lago Monte Alegre, Ribeirão Preto, SP, Brasil

We aimed to perform the first survey of testate amoebae community composition in Lake Monte Alegre at São Paulo state, and contribute to mitigate the taxonomic impediment regarding thediversity of testate amoebae in Brazil. Samplings were performed in 20 sampling sites within the lake, inthe limnetic and littoral regions in April 2015, using a 58 μm-meshplankton net. We identified 20 taxa oftestate amoebae belonging to four families: Arcellidae (8 taxa), Centropyxidae (4 taxa), Difflugiidae (7 taxa) and Lesquereusiidae (2 taxa). The littoral region showed the highest number of taxa (n = 20), whereas inthe limnetic region 11 taxa were registered. Therefore, our results evidenced the importance of testateamoebae in aquatic systems, and that further research, taxonomic and/or ecological, in those environmentsshould include these organisms in their investigation. Moreover, we suggest that future research with greater sampling effort is necessary to expand the identification of possible cryptic species in this environment.

O objetivo deste estudo foi realizar o primeiro levantamento da composição da comunidade de amebas testáceas no lago Monte Alegre no Estado de São Paulo e, assim, contribuir para mitigar oimpedimento taxonômico relacionado à diversidade de amebas testáceas no Brasil. As amostragens foramrealizadas em 20 pontos do lago, nas regiões limnética e litorânea, no mês de abril de 2015, com rede deplâncton de 58 μm de abertura de malha. Foram identificados 20 táxons de amebas testáceas, divididos emquatro famílias: Arcellidae (8 táxons), Centropyxidae (4 táxons), Difflugiidae (7 táxons) e Lesquereusiidae(2 táxons). A região litorânea apresentou o maior número de táxons (n = 20), enquanto que na regiãolimnética foram registrados 11 táxons. Diante disso, é possível indicar que os nossos resultados evidenciama importância das amebas testáceas nos sistemas aquáticos e que novos estudos, taxonômicos e/ou ecológicos, nesses ambientes devem incluir estes organismos em suas investigações. Além disso, sugeremsefuturos estudos com maior esforço amostral para ampliar a identificação de possíveis espécies crípticas noambiente.

Testate Amoebae (Amebozoa: Arcellinida) in Tropical Lakes of Central Mexico / Amebas testadas (Amebozoa, Arcellinida) en lagos tropicales del centro de México

AbstractTestate amoebae are common single-celled eukaryotic organisms in aquatic ecosystems. Despite their important role in these ecosystems, and their potential as bioindicators and paleoindicators, they remain poorly studied in Mexico. The major objectives of this study were to: 1) increase knowledge of testate amoebae in Mexico's tropical lakes, and 2) create a catalog of high-quality scanning electron micrographs that can be used for future ecological and paleoenvironmental studies. We collected surface-sediment samples from 29 lakes, located in the Transmexican Volcanic Belt, one at each lake during June and October 2011, and March 2013. Sediments were collected with an Ekman grab and preserved in anhydrous ethanol. Sub-samples were observed under a stereomicroscope and morphometric data for each species were recorded. Total diameter and aperture diameter were measured on circular tests. Irregularly shaped tests were measured for length and width of the aperture and for the size of the whole test. If a specimen possessed spines, the length of one randomly selected spine was measured. The best-preserved specimen of each taxon was photographed with an optical microscope and a scanning electron microscope (SEM). We found 41 taxa of testate amoebae belonging to the genera: Arcella, Argynnia, Centropyxis, Cucurbitella, Cyclopyxis, Cyphoderia, Difflugia, Euglypha, Lesquereusia, Pentagonia, Pseudodifflugia and Scutiglypha. Twelve species not previously reported for Mexico were recorded, along with 13 varieties. The average number of taxa recorded in each lake was eight, and the highest taxonomic richness was 18. The taxon found in the greatest number of lakes was Centropyxis aculeata var. aculeata. Taxonomic richness varied among lakes in the same region. This could reflect lake-specific differences in environmental conditions, underscoring the need for more detailed studies that include collection of data on physical and chemical variables in the lakes. Our results highlighted the need of further studies for the distribution patterns and ecology of lacustrine testate amoebae. Rev. Biol. Trop. 64 (1): 377-397. Epub 2016 March 01.

ResumenLas amebas testadas son organismos eucariontes unicelulares frecuentes en ecosistemas acuáticos. A pesar de su importante rol en estos ecosistemas, y su potencial como bioindicadores y paleoindicadores, son poco estudiados en México. Los principales objetivos de este estudio fueron: 1) incrementar el conocimiento de las amebas testadas en lagos tropicales de México y 2) crear un catálogo de microfotografías electrónicas de barrido de alta calidad que pueda ser usado en futuros estudios ecológicos y paleoambientales. Recolectamos muestras de sedimentos superficiales de 29 lagos, ubicados en la Faja Volcánica Transmexicana, una vez en cada lago durante junio y octubre 2011 y marzo 2013. Los sedimentos se recolectaron con una draga tipo Ekman y se preservaron en etanol anhidro. Las sub-muestras se observaron al microscopio estereoscópico. Para cada especie fueron registrados sus datos morfométricos. En testas circulares fueron medidos el diámetro y la apertura total. En testas irregulares fueron medidos el largo y ancho de la apertura y el tamaño de toda la testa. Si un ejemplar poseía espinas, se seleccionó una al azar y se midió su longitud. El ejemplar mejor preservado de cada taxón fue fotografiado con un microscopio óptico y en microscopio electrónico de barrido (MEB). Encontramos 41 taxa de amebas testadas pertenecientes a los géneros Arcella, Argynnia, Centropyxis, Cucurbitella, Cyclopyxis, Cyphoderia, Difflugia, Euglypha, Lesquereusia, Pentagonia, Pseudodifflugia y Scutiglypha. Se registraron 12 especies y 13 variedades que no estaban reportadas previamente en México. El número promedio de taxa registrados en cada lago fue de ocho, y la riqueza taxonómica mayor fue de 18. El taxón encontrado en el mayor número de lagos fue Centropyxis aculeata var. aculeata. La riqueza taxonómica compartida por lagos de la misma región no fue muy similar. Esto puede reflejar diferencias en las condiciones ambientales, evidenciando la necesidad de elaborar estudios más detallados que incluyan la recolección de datos de las variables físico-químicas en los lagos. Nuestros resultados resaltan la necesidad de estudios posteriores acerca de los patrones de distribución y la ecología de las amebas testadas lacustres.

Structure of the testate amoebae community in different habitats in a neotropical floodplain / Estrutura da comunidade de amebas testáceas em diferentes hábitats em uma planície de inundação neotropical

This study evaluated the differences in composition, abundance and morphology of testate amoebae among different habitats of the same aquatic environment (plankton, aquatic macrophyte and sediment) in the Upper Paraná River floodplain. Triplicate samplings were undertaken monthly at each habitat from April 2007 to March 2008. The structure of the community of testate amoebae was different among the habitats. The species typical for each habitat, according to Indval, were classified by their shell morphology. Arcella species together with Difflugia gramen and Difflugia pseudogramem were more abundant for plankton. Trinema and Phryganella stood out by their abundance and frequency in aquatic macrophytes. Centropyxis was an indicator of sediment. The results indicated a higher frequency of hemispherical and spherical shells in plankton and spherical and elongated shells in aquatic macrophytes. In the sediment, there was a high frequency of elongated species. Our results support the hypothesis that the community of testate amoebae has different structures among the habitats, refuting the idea that the organization of this community in plankton is guided by random events like the resuspension of organisms from the sediment and their displacement from marginal vegetation.

Este estudo avaliou as diferenças na composição, abundância e morfologia das amebas testáceas entre diferentes hábitats de um mesmo ambiente aquático (plâncton, macrófitas aquáticas e sedimento) da planície de inundação do alto rio Paraná. As amostras foram coletadas mensalmente no período de abril de 2007 a março de 2008. A estrutura da comunidade de amebas testáceas foi diferente entre os hábitats. As espécies típicas para cada hábitat, de acordo com o Indval, foram classificadas pela morfologia da teca. Espécies de Arcella, Difflugia gramen e Difflugia pseudogramem foram mais abundantes para o plâncton. Trinema e Phryganella destacaram-se pela alta abundância e frequência nas macrófitas aquáticas. Centropyxis foi considerado indicador do sedimento. Os resultados indicaram uma alta frequência de tecas esféricas e hemisféricas no plâncton e de tecas alongadas nas macrófitas aquáticas. No sedimento foi registrada uma maior frequência de espécies alongadas. Nossos resultados suportam a hipótese que a comunidade de amebas testáceas possui estrutura diferente entre os hábitats, refutando a ideia que a comunidade presente no plâncton é guiada por processos estocásticos como a ressuspensão dos organismos do sedimento e simples carreamento da vegetação marginal.

Potentially patoogenic free-living amoebae in sme flood-affected areas during 2011 chiang mai flood / Amebas potencialmente patogenicas de vida livre em algumas areas afetadas durante a inundacao de 2011 em Chiang Mai

SUMMARY The survey was carried out to investigate the presence of potentially pathogenic free-living amoebae (FLA) during flood in Chiang Mai, Thailand in 2011. From different crisis flood areas, seven water samples were collected and tested for the presence of amoebae using culture and molecular methods. By monoxenic culture, FLA were detected from all samples at 37 °C incubation. The FLA growing at 37 °C were morphologically identified as Acanthamoeba spp., Naegleria spp. and some unidentified amoebae. Only three samples (42.8%), defined as thermotolerant FLA, continued to grow at 42 °C. By molecular methods, two non-thermotolerant FlA were shown to have 99% identity to Acanthamoeba sp. and 98% identity to Hartmannella vermiformis while the two thermotolerant FLA were identified as Echinamoeba exundans (100% identity) and Hartmannella sp. (99% identity). This first report of the occurrence of FLA in water during the flood disaster will provide information to the public to be aware of potentially pathogenic FLA. .

RESUMO A pesquisa foi feita para investigar a presença de amebas de vida livre (FLA) durante a inundação em Chiang Mai, Tailândia, ano de 2011. A partir de diferentes áreas de inundação sete amostras de água foram coletadas e testadas para a presença de amebas usando métodos moleculares e de cultura. Através da cultura monoxênica, FLA foi detectada em todas as amostras após incubação a 37 °C. As FLA crescendo a 37 °C foram identificadas morfologicamente como Acanthamoeba spp, Naegleria spp e algumas amebas não determinadas. Somente três amostras (42,8%) definidas como FLA termotolerantes continuaram a crescer a 42 °C. Por métodos moleculares duas FLA termotolerantes tiveram 99% de identidade com a Acanthamoeba sp e 98% de identidade com Hartmannella vermiformis enquanto as duas FLA termotolerantes foram identificadas como Echinamoeba exundans (100% de identidade) e Hartmannella sp (99% de identidade). Este primeiro relato da ocorrência de FLA em águas durante inundações informa ao público que ele deve estar atento de FLA potencialmente patogênica. .

Isolamento e identificação de amebas de vida livre potencialmente patogênicas em amostras de ambientes de hospital público da cidade de Porto Alegre, RS / Isolation and identification of potentially pathogenic free-living amoebae in samples from environments in a public hospital in the city of Porto Alegre, Rio Grande do Sul

Um estudo sobre a presença de amebas de vida livre em um hospital público foi desenvolvido na Cidade de Porto Alegre, RS. Poeira e biofilmes de 15 ambientes hospitalares, incluindo CTI, UTI pediátrica, cozinha, emergência, centro cirúrgico ambulatorial e centro cirúrgico, reservatórios de água, torneira e 6 bebedouros coletivos foram coletados mensalmente, de julho de 2004 a março de 2005, usando-se suabes estéreis, preparados para a pesquisa. As AVL foram isoladas em cultivo, utilizando-se meio de ágar não nutriente adicionado de Escherichia coli, mortas pelo calor. A identificação dos protozoários foi feita pela observação morfológica de cistos e trofozoítos, segundo critérios morfológicos de Page (1988). Das 135 amostras coletadas dos 15 ambientes estudados, 47 (35 por cento) foram positivas para AVL. Destas, 34 por cento apresentaram características morfológicas próprias do gênero Acanthamoeba.

A study on the presence of free-living amoebae in a public hospital was developed in the city of Porto Alegre, State of Rio Grande do Sul. Dust and biofilms were collected using sterile swabs that had been prepared for this study, from 15 hospital environments, including the intensive care center, pediatric intensive care unit, kitchen, emergency room, outpatient surgical center, clinical surgical center, water storage tanks, taps and six drinking fountains for general use, every month from July 2004 to March 2005. The FLAs were isolated by culturing, using non-nutrient agar medium with the addition of heat-killed Escherichia coli. The protozoa were identified by morphological observation of cysts and trophozoites, in accordance with Page's morphological criteria (1988). Among the 135 samples collected from the 15 environments, 47 (35 percent) were positive for FLAs. Of these, thirty-four percent presented morphological characteristics particular to the genus Acanthamoeba.

Infecciones por amebas de vida libre. Comentarios históricos, taxonomía y nomenclatura, protozoología y cuadros anátomo-clínicos / Infections caused by free-living amebas: historical commentaries, taxonomy and nomenclature, protozoology and clinicopathologic features

Infections caused by free-living amebae constitute one of emergent opportunistic infections with greatest medical interest. Although infrequently, they have been described in almost all world, its diagnosis depends on a high index of suspicion, especially in morpho-pathologic and laboratory studies. Exciting historical features of infections due to free-living amebae, its taxonomy and the present nomenclature are briefly reviewed. An analysis of the protozoology of the most frequent agents is done and, based on the author's own experience and the published one, already established anatomo-clinical entities are described: the primary amebic meningoencephalitis, granulomatous amebic encephalitis, Acanthamoeba keratitis, cutaneous acanthamoebiasis, disseminated infection and other rare isolated locations.

Amebas patógenas de vida libre / Pathogenic free living amebas

Las pequeñas amebas de vida libre están ampliamente distribuidas en todo el mundo en continuo contacto con el hombre y animales; sus formas quísticas son capaces de sobrevivir en el suelo, aire y agua. Las infecciones causadas por las mismas han tomado en los últimos treinta años notable importancia médica ya que muchos casos fatales no fueron diagnosticados clínicamente ni por el laboratorio, debido al desconocimiento de la potencial capacidad patogénica de estas amebas. Hoy se sabe que la meningoencefalitis amebiana primaria (MAP) causada por Naegleria fowleri y la encefalitits amebiana granulomatosa (EAG) originada por especies de Acanthamoeba spp se han incrementado en el mundo tanto en sujetos sanos como en inmunocomprometidos, incluyendo muchos individuos con SIDA. El grupo más reciente de infecciones causadas por especies del género Acanthamoeba es la queratitis amebiana relacionada principalmente con la falta de cuidado en el mantenimiento de las lentes de contacto. La terapia de la queratitis es problemática debido a la presencia de quistes en los tejidos, y aunque se han informado algunas curas de pacientes, la terapéutica médica aún constituye un capítulo no resuelto

Amibas de vida libre patógenas para el hombre. Revisión del tema / Pathogenic free-living amebas for the men. Review of subject

Las amibas de vida libre de los géneros Naegleria y Acanthamoeba, pueden producir en los humanos, infección del SNC letal, denominada meningoencefalitis amibiana primaria y encefalitis amibiana primaria respectivamente. La infección por N. fowleri ocurre en individuos jóvenes sanos, mientras que la causa por Acanthamoeba, en individuos debilitados o con enfermedad crónica. Estos microorganismos tienen amplia distribución en la naturaleza y se encuentran con más frecuencia en aguas termales, albercas, lagos y lodo. Sin embargo, se desconoce su prevalencia. Los casos humanos informados en la literatura mundial, provienen en su mayoría de EE.UU. En la república mexicana, hasta la fecha sólo se han publicado tres casos humanos; además se han aislado cepas de amibas de vida libre en grifos y albercas de la Ciudad de México, así como en pacientes odoltológicos sanos